Category: Journal Club
[Journal Club] Introduction à la chimie bioinorganique et discussion sur l’égalité homme/femme en sciences, dans la seconde émission de Podchem en compagnie de Clotilde Policar
Dans cet épisode, présenté par Marc Hennebelle, en plus des chroniques de Titouan Chetot et de Maxime Ducreux, nous découvrons le monde passionnant de la chimie bio-inorganique et discutons des questions de parité dans les sciences. Lire aussi: Pourquoi si peu de femmes dans les carrières scientifiques ? de Clotilde Policar et Charlotte Jacquemot, dans The Conversation.
[Journal Club] X-ray absorption based approach to trap and accumulate a low populated and transient reaction intermediate of the Cu(II) reduction to Cu(I) in the peptide amyloid-β1-16
“Chasing the Elusive “In-Between” State of the Copper-Amyloidβ Complex by X-ray Absorption through Partial Thermal Relaxation after Photoreduction”, published by the group of Peter Faller in Angew Chem Int Ed Engl . 2023 Mar 3;e202217791. doi: 10.1002/anie.202217791
[Journal Club] Structure du site à fer dans la protéine d’échafaudage ISCU initiant l’assemblage des clusters fer-soufre
Des chercheurs du groupe Biologie Redox et Maladies de l’institut de Biologie Intégrative de la Cellule à Gif-Sur-Yvette, de l’Université de Kaiserslautern en Allemagne, de l’Institut de Chimie des Substances Naturelles à Gif-Sur-Yvette, du Synchrotron SOLEIL et du laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines à Marseille ont déterminé la structure du site de fixation du fer dans la protéine d’échafaudage des clusters fer-soufre en combinant des analyses par spectroscopies CD, Mössbauer, RMN, XAS et RPE. Ces résultats sont publiés …
[Journal Club] Structure d’une nouvelle famille de réductases impliquées dans l’assimilation du fer par les sidérophores chez les bactéries.
Des chercheurs du groupe Métaux et Microorganismes : Biologie, Chimie et applications Métalloprotéines de L’Université de Strasbourg, et de l’University of Hamburg ont déterminé la structure cristalline d’une nouvelle famille de réductases membranaires. Ces résultats sont publiés dans Proc Natl Acad Sci U S A, 2021, doi: 10.1073/pnas.2101952118.
[Journal Club] Un intermédiaire de maturation de l’hydrogénase à Fer observé par cristallographie.
Des chercheurs du groupe Métalloprotéines de l’institut de biologie structurale à Grenoble, de l’université UCDavis et de l’Illinois, aux États Unis, ont déterminé la structure cristalline d’un intermédiaire de maturation de l’hydrogénase à Fer.
[Journal Club] Contrôle à longue distance de la réactivité du site actif d’une métalloenzyme
L’étude de métalloenzymes a révélé que leur réactivité n’est pas seulement déterminée par les ligands directs leurs ions métalliques, mais aussi par les acides aminés voisins du site actif inorganique, ceux de la seconde sphère de coordination. Cette information a guidé la conception de complexes de métaux de transition biomimétiques très actifs. Des chercheurs du laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines (CNRS, Aix-Marseille Université) et des Universités de Bochum (Allemagne) et de Turin (Italie) viennent de démontrer dans la …
[Journal Club] “Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy: Fundamentals and Applications” by Patrick Bertrand, available in French and English
(fr) Les deux volumes du livre de Patrick Bertrand, “La spectroscopie de Résonance Paramagnétique Electronique”, sont disponibles dans la collection Grenoble Sciences. (en) The two volumes of the book “Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy” by Patrick Bertrand are now available in english from Springer
[Journal Club] Reconstituer le processus d’assemblage des centres Fe-S pour en comprendre les mécanismes et les pathologies associées
Un groupe de l’I2BC (CNRS, CEA, Université Paris-Saclay) en collaboration avec plusieurs autres équipes de l’université de Strasbourg, université de Kaiserslautern en Allemagne, ICSN à Gif-Sur-Yvette et Collège de France à Paris vient de parvenir à reconstituer une forme active de la machinerie de biosynthèse des centres Fe-S des mammifères.
[Journal Club] De l’araignée aquatique au catalyseur bioinspiré pour la transformation du CO2 en carburants
Une équipe du Collège de France et du CNRS vient de mettre au point un catalyseur sélectif à base de cuivre capable de transformer le dioxyde de carbone en carburants. Ces résultats sont publiés dans Nature Materials. Cette approche originale s’inspire de stratégies d’organismes vivants observées dans la nature.
[Journal Club] Unprecedented conformational dynamics in the C-cluster of CO-dehydrogenase
Elizabeth C Wittenborn, Mériem Merrouch, Chie Ueda, Laura Fradale, Christophe Léger, Vincent Fourmond, Maria-Eirini Pandelia, Sébastien Dementin and Catherine L Drennan: eLife 2018.
[Journal Club] Selective Formation of an FeIVO or an FeIIIOOH Intermediate From FeII-H2O2 : Controlled Heterolytic vs Homolytic O-O Bond Cleavage by the Second Coordination Sphere
Khaled Cheaib Muhammad Qadri Effendy Mubarak Katell Sénéchal-David Christian Herrero Régis Guillot Martin Clémancey Jean-Marc Latour Samuel de Visser Jean-Pierre Mahy Frédéric Banse & Frederic Avenier
[Journal Club] Pyranopterin Related Dithiolene Molybdenum Complexes as Homogeneous Catalysts for CO2 Photoreduction
Thibault Fogeron, Pascal Retailleau, Lise-Marie Chamoreau, Yun Li and Marc Fontecave
[Journal Club] Comprendre les transfert couplés d’un électron et de multiples protons dans le PSII
Une première concernant le transfert d’un électron et de deux protons au sein d’un modèle de la paire Tyrosine Z / Histine 190 de l’enzyme Photosystème II.
[Journal Club] Le CO2 à l’origine de la vie ?
Une simple réaction entre le dioxyde de carbone (CO2) et divers métaux dans de l’eau salée donne une nouvelle piste pour comprendre l’origine de biomolécules – et donc de la vie – sur Terre. Cette réaction pourrait expliquer comment certains organismes primitifs créaient les molécules nécessaires à leur survie à partir de CO2 avant l’apparition des protéines. Cette découverte d’une équipe de l’Institut de sciences et d’ingénierie supramoléculaire (CNRS/Université de Strasbourg) est parue dans Nature Ecology & Evolution. Une petite révolution en chimie …
[Journal Club] Des capteurs de lumière moins chers, moins toxiques et recyclables pour la production d’hydrogène
Mimer la photosynthèse des plantes pour convertir, grâce à la lumière, des molécules stables et abondantes comme l’eau et le CO2 en carburant hautement énergétique (l’hydrogène) ou en produits chimiques d’intérêt pour l’industrie, est aujourd’hui un défi majeur de la recherche.
[Journal Club] A mechanism for CO regulation of ion channels
Malgré sa très haute toxicité, le monoxyde de carbone (CO) est également un agent de signalisation intracellulaire essentiel, à l’instar de NO ou H2S. Les mécanismes moléculaires de cette signalisation sont cependant mal connus. Des chercheurs de l’Institut de Biologie Chimique et Structurale de Leicester (UK) ont fait appel à des spectroscopistes de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) à Saclay pour caractériser l’interaction de CO avec les canaux ioniques à potassium. Les résultats montrent que CO active …
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[Journal Club] AC Découverte: “Les chélateurs du fer pour le traitement du cancer : où en sommes-nous ?”
L’Actualité Chimique, a créé l’AC Découverte, une rubrique en libre accès sur le web qui sera régulièrement nourrie d’articles rendus accessibles aux lycéens et étudiants. Le premier article, sur les chélateurs du fer dans le traitement du cancer, est à découvrir en ligne dès à présent sur le site de L’Actualité Chimique.
[Journal Club] SCF: Les 40 ans de la division Chimie de coordination
Par Valérie Marvaud, Rinaldo Poli, Anna Proust, Actualité chimique, 424, 13-15 (2017). (Article gratuit) La division Chimie de coordination de la SCF a célébré son 40e anniversaire en janvier 2017. L’occasion de rappeler les différentes étapes de sa création, les précurseurs du domaine, d’évoquer les moments importants, et surtout de rendre hommage aux principaux acteurs. C’est en réunissant les témoignages des anciens présidents de la division que nous avons pu collecter les informations qui retracent quarante années d’une chimie qui a été mise à l’honneur …
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[Journal Club] Comprendre le cycle de Krebs inverse, une réponse à l’origine de la vie ?
Les chercheurs de l’Institut de science et d’ingénierie supramoléculaires (CNRS/Université de Strasbourg) sont parvenus à reproduire de manière non enzymatique six des onze étapes qui constituent le cycle de Krebs inverse. Ce cycle, au cœur du métabolisme de certains organismes primitifs, leur permet notamment de se maintenir en vie. L’originalité du travail ? Sa réalisation dans un environnement pré-biotique c’est-à-dire dépourvu d’enzymes, que l’on pensait nécessaires à ces réactions métaboliques. Une avancée dans la compréhension des origines de la vie… Ces …
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[Journal Club] “Biomimétisme : s’inspirer de la nature pour rendre l’innovation plus soutenable”
Par Gilles Bœuf, Université Pierre et Marie Curie (UPMC) – Sorbonne Universités. “La nature est bien faite ! En l’étudiant avec humilité et curiosité, on peut y trouver une infinité de solutions pour imaginer et mettre au point des innovations respectueuses des écosystèmes. (…)”
[Journal Club] Voices of Inorganic Chemistry (American Chemical Society)
ACS interviews or H B Gray, S J Lippard, T J Meyer, E I Solomon, D J and M Darensbourg, K Weighardt, R H Holm, and others
[Journal Club] Production d’électricité : quand des enzymes rivalisent avec le platine
Une biopile aussi efficace qu’une pile à combustible au platine : c’est la prouesse qu’ont réussie des chercheurs du laboratoire de Bioénergétique et ingénierie des protéines (CNRS/Aix-Marseille Université), en collaboration avec le Centre de recherche Paul Pascal (CNRS/Université de Bordeaux) et l’Institut universitaire des systèmes thermiques industriels (CNRS/Aix-Marseille Université).
[Journal Club] Quand chimie et médecine s’unissent pour lutter contre les maladies inflammatoires de l’intestin !
A cell penetrant manganese SOD-mimic is able to complement MnSOD and exerts an anti-inflammatory effect on cellular and animal models of inflammatory bowel diseases. In English here.
[Journal Club] Publication des actes du colloque “Biomimétisme et chimie durable” par le ministère de l’Environnement
La démarche biomimétique en recherche et développement peut-elle susciter de nouvelles « ruptures » soutenables en chimie ? Quelles voies de recherches, directement inspirées du métabolisme du vivant, sont explorées aujourd’hui en France, dans le contexte de la transition énergétique et au service de procédés chimiques novateurs et décarbonés ?
[Journal Club] Quand l’oxygène empêche de produire de l’énergie
La dégradation par l’oxygène des hydrogénases, enzymes qui produisent du dihydrogène, prive les biotechnologies de catalyseurs performants. Comprendre les mécanismes qui conduisent à cette dégradation, c’est l’objectif des chercheurs du Laboratoire de bioénergétique et ingénierie des protéines (CNRS/AMU), de biochimistes toulousains (INSA), parisiens (CEA), et de chimistes théoriciens européens et américains. Ils sont parvenus à caractériser chacune des étapes de la réaction complexe qui mène à destruction de l’enzyme par l’oxygène. Les résultats de cette étude ont été publiés dans la revue Nature Chemistry.
[Journal Club] Production d’hydrogène : premier modèle reproduisant l’activité centrée sur le nickel de l’hydrogénase [NiFe]
L’utilisation de nouvelles sources d’énergie propres représente un objectif majeur pour nos sociétés modernes dont les besoins en énergie augmentent constamment. La mise au point de procédés pour la production d’hydrogène via des ressources renouvelables tels que l’eau ou l’énergie solaire représente une solution séduisante.
[Journal Club] Cibler les métaux pour lutter contre le staphylocoque doré
Des chercheurs du CEA, du CNRS, d’Aix-Marseille Université et de l’INRA ont découvert un système original d’acquisition des métaux essentiels chez une bactérie pathogène, le staphylocoque doré. Il représente une nouvelle cible potentielle pour la conception d’un antibiotique. Ces résultats font l’objet d’une publication le 27 mai 2016 dans la revue Science.
[Journal Club] Un système chemo-enzymatique pour oxyder les oléfines avec de la lumière et du dioxygène
Les réactions d’oxydation nécessitent généralement des conditions de réaction sévères et des quantités stœchiométriques d’oxydants qui sont souvent toxiques. Une équipe composée de chercheurs de l’Institut des sciences moléculaires de Marseille (CNRS / AMU) et de Institut de chimie moléculaire et des matériaux d’Orsay (CNRS / Université Paris-Sud) a récemment couplé la formation d’époxyde à la réduction d’oxygène atmosphérique grâce à un photo-catalyseur hybride composé d’un complexe de ruthénium et de l’enzyme laccase. Ces travaux sont publiés dans la revue …
[Journal Club] Chimie bio-inspirée: un complexe de fer pour produire de l’éthylène
Des chercheurs de l’Institut des sciences moléculaires de Marseille (CNRS / Aix Marseille Université) et de l’Université Humboldt de Berlin ont récemment isolé et caractérisé un modèle structural et fonctionnel du centre actif d’une enzyme de fer(II) non hémique catalysant la dernière étape de la biosynthèse de l’éthylène chez les plantes.
[Journal Club] Catalyse de la production d’hydrogène: comment fonctionnent les complexes métalliques ?
A Brest, des chercheurs viennent de montrer qu’un mécanisme CPET était à l’œuvre dans la réactivité d’un complexe d’hydrure de tungstène. Ces résultats sont parus dans la revue Nature Chemistry.
[Journal Club] Alzheimer’s disease & Zinc: the missing link?
Christelle Hureau, LCC, Toulouse, was awarded an ERC grant for funding research about Alzheimer’s disease (AD)
[Journal Club] Un nouveau catalyseur pour des réactions d’oxydation plus vertueuses
Des chimistes parisiens démontrent que des réactions d’oxydation peuvent être effectuées dans des conditions douces en utilisant une source d’atomes d’oxygène propre et renouvelable (H2O), la lumière visible comme source d’énergie et un métal non noble et abondant comme catalyseur (fer).
[Journal Club] Activation d’enzymes bactériennes pour convertir le CO2 en source d’énergie renouvelable
Des chercheurs du CEA, du CNRS et d’Aix-Marseille Université décrivent le mécanisme d’activation d’enzymes bactériennes qui transforment naturellement le CO2 en acide formique, composé à forte valeur énergétique. La description du mécanisme d’activation de ces enzymes, les formiate déshydrogénases (FDHs), représente une avancée importante pour développer, à terme, des biotechnologies appliquées aux énergies renouvelables.
[Journal Club] Un système chemo-enzymatique pour oxyder les alcools à température ambiante
En combinant un complexe de palladium avec une enzyme (oxydase), les chercheurs de l’Institut des sciences moléculaires de Marseille (CNRS / AMU) viennent de décrire le premier exemple de système catalytique couplé permettant l’oxydation d’un alcool à température ambiante et à pression atmosphérique.
[Journal Club] Une autre façon de “voir” le mécanisme des métalloenzymes
Des chercheurs marseillais décrivent comment une combinaison d’informations issues de techniques très variées (mutagenèse dirigée, DFT, MD, cinétique électrochimique) permet de mieux comprendre certains aspects très variés du mécanisme catalytique de métalloenzymes.